A JBS e outras empresas do setor foram investigadas por um esquema de suborno a fiscais de frigoríficos dentro da Operação Carne Fraca da polícia federal. O arranjo permitia a venda de carne podre e a falsificação de documentos de exportação, além de causar falhas deliberadas na inspeção de plantas frigoríficas. As acusações contra os frigoríficos incluíam o uso de produtos químicos para disfarçar carne estragada, o que levou a uma série de suspensões de exportação da carne brasileira para diferentes países.